La Catedral de Manila ó sea reseña cronológica de su origen y restauraciones sucesivas desde su primitiva fundacion hasta su reconstruccion actual [...] / por el Joaquín Fonseca. - Manila, 1880.

Los mártires dominicos del Extremo Oriente / [Joaquín Fonseca]. - Milan, 1877.

Historia de los pp. Dominicos en las islas Filipinas y en sus misiones del Japon, China, Tung-Kin y Formosa / obra original é inédita del m.r.p. fr. Juan Ferrando. - Madrid, 1870-1972. ed.

Discurso inaugural dicho en el Colegio de Santo Tomás de Avila / por Joaquín Fonseca ... en la apertura del curso académico de 1888 á 1889. - Madrid, 1888.

Santo Tomás de Aquino en presencia de san Alberto Magno, ó sean, Los dos genios / por el m.r.p. fr. Joaquin Fonseca. - Manila, 1874.

Contestación de un tomista a un filósofo del Renacimiento / [Joaquin Fonseca]. - Madrid, 1882.